国鉄

　国鉄新潟支社では地震後しばらくして通信が途絶したが、一部使用が可能であった長岡指令線により管内全域向け緊急指示として、（1）運転中の列車を直ちに停止させる措置をとること、（2）旅客に対する万全の措置を講ずること、（3）併発事故の防止に努めることなどを連絡し、次いで13時10分、支社の庁舎脇に震害対策本部を設置して、状況の把握と応急対策の推進にあたることとなった。

　対策本部では、早速、地震直後の状況の把握と緊急手配の体制を固め、通信線の回復と夜間照明の確保とに主力をおいた。まず通信線についての調査結果から新潟−新津間の地下ケーブルが健全であることが確認されたので、急速に回線構成を進める一方、同日夜半には新潟駅構内の照明も復活できたので、その後の応急措置は急速に進められた。復旧活動は、国鉄職員が主体となって昼夜をわかたぬ作業が進められ、当面の応急措置として新津以南の幹線確保に全力が注がれた結果、17日早朝までには上越線、信越本線（亀田以南）の復旧に成功することができた。しかし、新潟駅構内の陥没および笹口跨線橋の橋桁落下のため、上信越線・白新線からの新潟乗り入れは不可能であったので、6月17日に上野−新潟間の急行列車を新津折り返しとして、他に長岡−亀田間に電車・気動車を10往復運転して急行列車の接続とローカル輸送を確保し、さらに亀田−新潟間には国鉄自動車を連絡させて輸送の強化を図った。

　6月18日には、新潟駅の北東500mの場外に笹口仮乗降場が設けられ、震災から4日目を迎えた翌19日には新潟乗り入れの初列車として、13時40分過ぎに長岡からの6両編成の電車がそれぞれ親類や知人の安否を気遣う約1,500名の乗客を乗せて、この仮乗降場へすべり込んだ。この日から上信越線・白新線からのローカル列車が新潟地区に引き込める状況となった。

　一方、残る新潟駅構内の早期復旧にも全力が注がれた結果、一部施設の復旧により笹口仮乗降場−新潟間も24日には列車の乗り入れが可能な状態となり、5時47分に上野発の下り急行〔越後〕が朝の光を浴びて7番線ホームへ静かにすべり込み、ホームに出迎えた保線区員や自衛隊員の間から一斉に万歳の歓声がわき上がった。ここに地震後185時間にして列車の新潟駅乗り入れは成功したのである。

　また、新潟地区の緊急物資の受け入れをはじめとして貨物取扱体制の整備も重要な問題であり、港湾施設関係の貨物駅がほとんど壊滅的な打撃を受けているため、応急対策も見込めない状態から、とりあえず新津、亀田、関屋、新発田などの周辺各駅において臨時の取扱を行って急場を凌いできたが、20日には上沼垂−沼垂間が復旧するのと同時に、沼垂駅の抜本的な改善に着手し、当面する体制の強化を図ることとなった。

　管内各線における被害の復旧は、6月20日にいたって新潟周辺と、羽越本線・勝木−小岩川間、磐越西線・白崎−津川間を残していずれも開通し、列車の運転も平常のほぼ50％に達した。このうち勝木−小岩川間は、19日に発生した余震とその夜半から翌朝にわたって激しく降った雨のため、新たな土砂崩壊に見舞われて被害を重ねたものであり、白崎−津川間は17日にいったん開通した後、落石の危険があって再度不通になったものであって、白崎−津川間は23日早朝に再復旧した。

　被害の激しかった越後線・新潟−関屋間は、21,000m³に及ぶ路盤の陥没と、信濃川橋梁の橋脚の傾斜、白山駅ホームの破壊などのため、新規に施設を建設するような復旧工事が続けられ、7月7日にいたってようやく白山−関屋間の開通にまでこぎつけ、7月12日に新潟−白山間の開通をみることができた。この間、通勤利用者は連日徒歩またはバスによらなければならず、地震直後には鉄道線路を歩いて往来する通勤利用者の姿も後を絶たなかった。

　この越後線の開通によって地震発生以来22日目にして初めて旅客関係では支社管内全線が回復することとなった。

　一方、港湾施設内にある貨物取扱駅については、水没区域を残して東新潟港構内が7月16日に、また新潟港駅構内が7月29日それぞれ仮復旧を終えた。

私鉄

　新潟県内の私鉄関係は、地震の被害を受けて不通となったもの、あるいは安全運転のため一時運行の休止を行うものなど、それぞれ臨機の措置がとられたが、そのなかでも大きな被害を受けたのは新潟交通が営業している燕−県庁前間の電鉄軌道であった。この軌道は一級国道8号線の道路の中央に埋設されており、国道は地震によって相当な被害を受けたため、軌道はくねり、一部では地中に埋まって無軌道の道路と変わらないような状況もみられた。道路の両側には民家が密集しており、かつ非常に狭い道路であるため復旧はむしろある程度落ち着いてから行われた方がよいとの事情などがあり、電鉄の利用者にとっては不便なことではあったが、新潟旧市内への乗り入れのための工事は見送られ、燕−東関屋間の郊外線だけは地震後まもなく開通した。東関屋−県庁前間は1964年暮れ近くから復旧工事が行われて、地震から半年近くを経た1965年（昭和40年）1月1日より全面的に運転を再開した。

　この他の私鉄は地震後まもなく平常運行ができるようになった。